Szójegyzék

2-Abz - 2-Aminobenzoil, általában 2,4-dinitrofenil (Dnp) vagy 3-nitro-tirozin (NitroTyr) kombinációjával fluorofor/Quencher párokat képez. gerjesztés 320 nm-en, emisszió 420 nm-en.

3-Az Abz (m-aminobenzoesav) -aminosavnak tekinthető. Ha az m-amino-benzoesav beépül a peptidláncokba, az merev fordulatot eredményez.

4-Az Abz (p-aminobenzoesav, PABA), mint a természetben előforduló benzoesav származék, merev lineáris távtartóként is használható.

Abu, L- -Aminobutiryl ((S)-2-Amino-butanoil), -aminovajsav, aminosavszármazék. A természetes aminosavakhoz való szerkezeti hasonlósága miatt gyakran használják peptidek és peptidutánzók tervezésében és szintézisében.

Az Ac jelentése acetilcsoport. Az N-terminális acetilezés a peptidek általános stabilizáló módosítása a természetben.

Az Acm, az acetamidometil, Hg(II) vagy Ag(I) alkalmazásával távolítható el. Ez az egyik leggyakrabban használt tiol védőcsoport a cisztein számára, amikor többszörös diszulfidkötést tartalmazó peptideket szintetizálnak.

Az ACTH (adrenokortikotrop hormon) az agyalapi mirigy elülső része által termelt hormon, amely a mellékvesekéreget kortikoszteroidok termelésére serkenti.

Az Aad (L- -amino-adipinsav) egy nem proteinogén aminosav. Szerkezete hasonló a glutaminsavhoz (Glu), oldalláncában további metiléncsoport található.

Az (2-amino-etoxi)-ecetsav, más néven glicin-etil-észter vagy glicin-etil-amid, távtartóként vagy linkerként használható a peptidmódosítási szintézisben.

Az 1-(1'-adamantil)-1-metil-etoxikarbonil, amely a peptidszintézisben nagyon savlabilis amino-védőcsoport, 3%-os TFA/CH2Cl2-vel eltávolítható

Az AFC (7-amino-4-trifluormetilkumarin) egy fluoreszcens vegyület, amely a felszabaduló kumarint gerjeszti 395-400 nm-en, emissziója 495-505 nm-en.

A kisebb fajok nem kovalens adhéziója miatt nagyobb molekulatömegű fajok keletkeznek. Különösen a fehérjékben az aggregáció a denaturáció egyik formája, amely másodlagos szerkezetű, nem poláris felületeken fordulhat elő, például azokon, amelyek tipikusan intramolekuláris kölcsönhatásokat képeznek, és a fehérje hélixeibe és lapjaiba temetkeznek. A molekulák kölcsönhatásba lépnek egymással, néha oldhatatlan polimolekuláris formákat képezve. Az aggregáció ellentétben áll az oligomerizációval, a helyesen feltekeredő natív fehérjék normál kölcsönhatásával, hogy magasabb rendű polimereket képezzenek.

AHX, aminohexanoil, 6-amino-hexánsav, más néven Aca vagy LC, általában rövid, nem poláris távtartóként kerül bevezetésre a biotin, a fluoroforok és a peptidszekvenciák közé.

2-Az aminoizovajsav egy ritka, nem fehérjetartalmú aminosav, amely a pirimidin metabolizmusának végterméke, és kiválasztódik a vizelettel, és jelen van néhány gombás eredetű antibiotikumban. Természetes aminosavak helyettesítésére is használják a peptidszintézishez.

Az alkoholok olyan szerves vegyületek, amelyeket egy, két vagy több hidroxilcsoport (-OH) jelenléte jellemez, amelyek egy alkilcsoportban vagy szénhidrogénláncban kapcsolódnak a szénatomhoz. A peptidalkoholok klinikailag döntő jelentőségű vegyületek, amelyeket nem vizsgáltak kellőképpen a szerkezet-aktivitás kapcsolat (SAR) vizsgálatok a gyógyszerkutatáshoz. Például a DAMGO egy opioid receptor agonista, amelyet alkohol módosított a C-terminálison, Tyr-{d-Ala}-Gly-{Me-Phe}-Gly-ol szekvenciájával. Nagy szelektivitással és affinitással rendelkezik a μ-opioid receptorhoz.

Az aldehid olyan szerves vegyület, amelyben a karbonilcsoport a szénlánc végén egy szénatomhoz kapcsolódik. A peptid-aldehidek fontos eszközök a biokémiában és a kémiai biológiában a proteázok gátlására és kémiai hatástalanítására.

Aloc - Alliloxikarbonil, amino-védőcsoport (más néven Alloc). A védelem Pd(PPh3)4-gyel eltávolítható.

Az Alzheimer-kór, amelyet -amiloid plakkok és tau-gubancok jellemeznek, a szinaptikus diszfunkció és a kiürülési útvonal problémák következménye, ami kognitív károsodást okoz.

Az 7-amino-4-metilkumarin (AMC) egy gyakori fluoreszcens próba a peptidjelöléshez a proteázvizsgálatokban. Peptidhez való konjugációja kioltja a fluoreszcens szignált, és a proteázhasításkor felszabaduló AMC képes számszerűsíteni az enzimaktivitást, 345/445 nm gerjesztési/emissziós maximumokkal. Például az előnyös szubsztrát fluoreszcens peptid a tisztított proteaszóma tripszinszerű aktivitásának meghatározására, a következő szekvenciával: Ac-Arg-Leu-Arg-AMC.

Pitvari natriuretikus peptid (ANP), a szív pitvarai által termelt és felszabaduló hormon a megnövekedett vértérfogat és nyomás hatására. Szabályozza a folyadékegyensúlyt és a vérnyomást azáltal, hogy elősegíti az értágulatot, fokozza a vizelettermelést (diurézist), és csökkenti a nátrium-visszaszívódást a vesékben. Ezek az intézkedések segítenek a magas vérnyomás és a szervezet folyadéktúlterhelésének hatásainak ellensúlyozásában.

Az antigén peptidek fehérjékből vagy más biomolekulákból származó rövid aminosavszekvenciák, amelyek kiváltják a szervezet immunválaszát. Ezeket a peptideket az immunrendszer idegenként vagy a szervezet számára idegenként ismeri fel, ami az immunsejtek, például a T- és B-sejtek aktiválásához vezet. Az antigén peptidek döntő szerepet játszanak az immunválaszokban, beleértve az adaptív antitest-termelést és az immunmemória kialakulását. Széles körben tanulmányozzák őket az immunológia és a vakcinafejlesztés területén, mivel képesek specifikus immunválaszt kiváltani kórokozók vagy abnormális sejtek ellen.

A 2, 4 és 8 elágazású aszimmetrikus peptidek szintézise megvalósítható lizin, arginin vagy glutaminsav stratégiai beépítésével a peptidszekvenciába.

Az aszimmetrikus dimetil-arginin (ADMA, Arg(Me)2) egy természetben előforduló kémiai vegyület, és a nitrogén-monoxid-szintáz (NOS) endogén inhibitora. Az Fmoc-Arg(Me)2-OH (aszimmetrikus) közvetlenül használható aszimmetrikus dimetil-arginint tartalmazó peptidek szintézisére.

5-Az aminovalérsav, távtartóként vagy linkerként használható a peptidmódosítási szintézisben.

A benziloximetil (Bom) egy savra labilis imidazol védőcsoport, amelyet a Boc-SPPS eljárásban hisztidin tartalmú peptidekhez használnak. A benziloximetil savval végzett kezelés után rendkívül reakcióképes formaldehidet termel. Ezért a Bom a legjobban Cys, metoxiamin vagy más, aldehidekkel reagáló vegyületek jelenlétében hasítható.

-aminosavak aminocsoportja a -szénhez kapcsolódik, amely a karboxilcsoporttól távolabbi második szénatom. Az -aminosav általános szerkezeti képlete a következő: R-CH(NH2)-COOH

B-típusú natriuretikus peptid (BNP), egy hormon, amelyet főként a szívkamrák termelnek válaszul a szívizomsejtek túlzott megnyúlására. Döntő szerepet játszik a vérnyomás és a folyadékháztartás szabályozásában, elsősorban az értágulat elősegítése és a vesén keresztüli nátriumkiválasztás fokozása révén.

A t-Butiloxikarbonil (Boc) egy nagyon sav-labilea-amino védőcsoport a peptidszintézisben, hasítható TFA/metilén-klorid (1:1), HCl etil-acetátban vagy dioxánban, 98%-os hangyasavval.

A 2-(4-bifenilil)izopropiloxikarbonil (Bpoc) egy nagyon sav-labilea-amino-védőcsoport a peptidszintézisben, 1%-os TFA/metilén-kloriddal lehasítható.

A 2, 4 és 8 elágazású peptidek a peptidszekvenciába lizin, arginin vagy glutaminsav stratégiai beépítésével érhetők el.

A t-butil-dimetil-szilil (TBS vagy TBDMS) egy hidroxil-védőcsoport, amely kompatibilis az Fmoc-SPPS-szel. Savlabilis, fluoridionokkal szelektíven hasítható.

A benzoil egy acilcsoport, amelyet gyakran a peptidek N-terminálisához vezetnek be. Kevésbé poláris, mint az acetil (Ac), és állandó módosításként használható.

Benzil (Bzl) egy alkilmaradék és egy oldallánc védőcsoport, amelyet alkoholok (Ser, Thr, Hyp) blokkolására használnak a peptidszintézisben. erős savakkal vagy katalitikus hidrogenolízissel (pl. hidrogén/Pd) hasítható.

A kolecisztokinin (CCK) egy peptid hormon, amelyet a felső bél nyálkahártyája termel, és a központi idegrendszerben található. Serkenti az epehólyag összehúzódását, a hasnyálmirigy enzimek felszabadulását, és befolyásolja a különböző gyomor-bélrendszeri folyamatokat.

A kalcitonin génhez kapcsolódó peptid (CGRP) egy 37-aminosav peptid, amely rokon a kalcitoninnal, az amilinnel és az adrenomedullinnal. Két formában létezik: -CGRP (CGRP I) és -CGRP (CGRP II), hasonló biológiai aktivitásokkal. A CGRP elsősorban a szenzoros és központi idegsejtekben található, befolyásolja a szív- és érrendszeri működést, a kalcium-anyagcserét és a magzati placenta értónusát. Receptorai G-fehérjéhez kapcsolódnak, és aktiválják az adenilát-ciklázt, kölcsönhatásba lépve a receptoraktivitást módosító fehérjékkel (RAMP) a ligandumspecifitás és a sejtforgalom érdekében.

Az L-ciklohexilalanin (Cha) a fenilalanin egy nem poláris aminosav-analógja, ahol az aromás gyűrűt ciklohexángyűrű helyettesíti. Ez a szubsztitúció lehetővé teszi az aromás aminosavak szerepének tanulmányozását az olyan kölcsönhatásokban, mint a π-π kölcsönhatások a fenilalanin csoportok Cha-val való helyettesítésével kísérletekben.

L- -A ciklohexilglicin (Chg) egy nem poláris aminosav, amely sztérikusan gátolt. Jelentős gyógyszerészeti intermedierként szolgál, és természetes termékekben is megtalálható.

A koleszterint természetesen a máj és a szervezet más sejtjei termelik, de származhat az általunk fogyasztott élelmiszerekből is, különösen állati eredetű termékekből, például húsból, baromfihúsból és teljes zsírtartalmú tejtermékekből. A koleszterin peptidekhez köthető a farmakokinetika javítása érdekében.

cisz-hidroxiprolin, a természetes transz-hidroxiprolin sztereoizomerje.

A citrullin az argininmaradékok poszttranszlációs enzimatikus módosítása eredményeként van jelen a fehérjékben.

A CMK egy RSK2 kináz inhibitor, hasonló hatékonysággal, de kevésbé kémiai stabilitással, mint az FMK.

A C-típusú natriuretikus peptid (CNP) a vaszkuláris endotélsejtek által termelt peptid, amely értágító hatásairól ismert. Szerkezeti és fiziológiai hasonlóságokat mutat a pitvari és agyi nátriuretikus peptidekkel (ANP és BNP).

Az L- -A ciklopentilglicil (Cpg) egy nem poláris aminosav, amely sztérikusan gátolt.

A peptidszekvenciában az az egyedi aminosav, amely aminocsoportjával kapcsolódik a lineáris szekvenciához, szabad karboxilcsoportot hagyva benne. Ennek a maradéknak a karboxilcsoportja módosulhat, mint például amidálás, vagy – például piroglutamát – belső laktamizáció.

A cianin 3 egy vörösen fluoreszkáló cianin festék, amelyet általában 558 nm körüli fényforrás gerjeszt, és körülbelül 572 nm-en bocsát ki fényt.

A cianin 5 egy cianin festék fluorofor, amely közeli infravörös fluoreszcenciát bocsát ki, amelyet általában egy 646 nm körüli fényforrás gerjeszt, és körülbelül 664 nm-en bocsát ki fényt.

Az L-, -diamino-vajsav egy ,ω-diaminosav, az ornitin (Orn) és a lizin (Lys) rövidebb analógja. Megfelelő védelem mellett az ,ω-diaminosavak szelektíven módosíthatók Nω-helyzetükben, vagy beépíthetők elágazó láncú peptidek vagy dendrimerek létrehozására.

A 3-(dimetilaminoazo)benzol-4-karbonsav egy aminocsoportokhoz kapcsolódó kromofor, amelyet biokémiai és molekuláris biológiai alkalmazásokban használnak kioltóként a fluoreszcencia rezonancia energiaátvitelben (FRET), például az EDANS-szal. A DABCYL gerjesztése 454 nm-en.

Dabsil, 4-dimetil-amino-benzolszulfonil-klorid, aminocsoportokhoz kapcsolódó kromofor, amelyet kioltóként használnak, pl. EDANS-szel kombinálva. Dabsyl gerjesztése 436 nm-en.

4-Dimetilamino-1-naftalin-szulfonil, aminocsoportokhoz kapcsolódó fluorofor, gerjesztés 342 nm-en, emisszió 562 nm-en.

Az L-, -diamino-propionsav (Dap vagy Dpr) egy ,ω-diaminosav, amely a diaminovajsav (Dab), az ornitin (Orn) és a lizin (Lys) rövidebb analógja. Az ,ω-diaminosavak módosított származékai szelektíven megváltoztathatók Nω-helyzetükben, vagy beépíthetők elágazó láncú peptidek vagy dendrimerek létrehozására.

A 1-(4,4-Dimetil-2,6-dioxociklohex-1-ilidén)etil (Dde) egy amino-védőcsoport, amelyet a peptidszintézisben használnak. Dimetil-formamidban (DMF) készült 2%-os hidrazin-hidráttal szelektíven hasítható. Az Nω-Dde lehetővé teszi a Dde specifikus eltávolítását olyan aminosavakból, mint a Dap, Dab, Orn vagy Lys az Fmoc szilárd fázisú peptidszintézis (SPPS) után, megkönnyítve a Nω-aminocsoport gyantán történő módosítását.

A diszulfid kötések kovalens kötések, amelyek a fehérjékben lévő cisztein két szulfhidril (-SH) csoportja között jönnek létre.

A 2,4-dimetoxibenzil egy savra labilis formamid védőcsoport, amelyet a peptidszintézisben a gerinc reverzibilis módosítására használnak. A szilárd fázisú peptidszintézis (SPPS) során beépülnek Fmoc-Dmb aminosavként vagy dipeptidként (Fmoc-Xaa-DmbYaa-OH), ahol az Fmoc megakadályozza a peptid aggregációt, és így elősegíti a hatékony megnyúlást. A Dmb emellett elősegíti a ciklizációs reakciókat és megakadályozza az aszparagimid képződését. A Hmb-származékokkal ellentétben a Dmb nem képez benzoxazepineket az aktiválás során.

2,4-A dinitrofenil aminocsoportokhoz konjugált kromofor, amelyet általában kioltóként használnak a fluoreszcencia rezonancia energiatranszfer (FRET) szubsztrátjaiban.

A 4,4′-dimetoxiditil, más néven bisz-(4-metoxifenil)metil, egy savra labilis karboxamid védőcsoport, amely kompatibilis az Fmoc szilárd fázisú peptidszintézissel (SPPS).

A DOPA, a 3,4-dihidroxifenilalanin számos kulcsfontosságú neurotranszmitter előanyaga, köztük a dopamin, a noradrenalin és az epinefrin.

(4,7,10-trikarboximetil-1,4,7,10-tetraazaciklododecil)-ecetsav, rövidítve DOTA, egy ciklikus kelátképző, amely jellemzően a peptidek N-terminálisához kapcsolódik. A DOTA megkönnyíti a peptidek radionuklidokkal, például 68Ga-val vagy 90Y-val történő jelölését különféle orvosbiológiai alkalmazásokhoz, beleértve a képalkotást és a célzott terápiát.

Difenilmetil (ditil), savra labilis N-, O- és S-védőcsoport.

A dietilén-triamin-pentaecetsav (DTPA) hasznos kelátképző szer az olyan radionuklidok számára, mint a (68)Ga, (99m)Tc és (111)In, amelyek a nukleáris medicina képalkotásában alkalmazhatók.

5-[(2-Aminoetil)amino]naftalin-1-szulfonsav (EDANS) egy fluorofor, amely általában a diaminosavak, például a lizin Nω-jához kapcsolódik. Gyakran használják FRET szubsztrátumokban, általában párosítva olyan kioltókkal, mint a DABCYL. Az EDANS gerjesztési hullámhossza 340 nm, és 490 nm-en bocsát ki.

Endothel monocita aktiváló polipeptid.

Az etilt, a metil (Me) alkilcsoportját és homológját a peptidek állandó N- és S-etilezési módosítására használják.

Az epitóp-térképezés (antigén-epitóp-térképezés) egy olyan technika, amelyet az antigénen az antitestek vagy az immunrendszer által felismerhető specifikus területek (azaz antigén-epitópok) meghatározására használnak. Az antigén epitópok lineáris epitópokra és konformációs epitópokra oszthatók. Az antigén epitóp térképezés révén mélyen megérthetjük az antigén szerkezete és működése közötti összefüggést, aminek nagy jelentősége van a vakcinafejlesztésben, a betegségek diagnosztizálásában, az immunterápiában és egyéb szempontok szerint.
Néhány általánosan használt antigén epitóp feltérképezési módszer a következők:
Röntgen-krisztallográfia: Közvetlenül elemzi az antigén háromdimenziós szerkezetét, ezáltal meghatározza az epitóp helyzetét.
Mágneses magrezonancia: Az antigén szerkezetének elemzésére is használható az epitóp meghatározására.
Peptidszkennelési technika: Egy sor átfedő szintetikus peptid szegmens használata az antitesthez kötődő epitóp azonosítására.
Például az oltóanyagok kutatásában és fejlesztésében az antigén kulcsepitópjainak tisztázása segít hatékonyabb vakcinák tervezésében és célzottabb immunválasz kiváltásában; a betegségdiagnosztikában az egyes betegségekhez kapcsolódó antigén epitópok meghatározásával pontosabb diagnosztikai reagensek fejleszthetők ki.

A 5-FAM (5-karboxifluoreszcein) egy biomolekulák jelölésére általánosan használt fluorofor, amelynek gerjesztési hullámhossza 490 nm, emissziója 520 nm.

A fluoreszcein{0}}karbonil egy aminocsoportokhoz kapcsolódó fluorofor, amelynek gerjesztési hullámhossza 490 nm, emissziója 520 nm.

A fluoreszcein-izotiocianát (FITC) egy fluorofor, amely aminocsoportokkal reagál. Amikor egy peptidet az N-terminálisán FITC-vel jelölünk meg, általában távtartót, például -alanint vagy Ahx-t helyeznek be. A FITC gerjesztési hullámhossza 490 nm, emissziója 520 nm.

9-A fluorenil-metil egy bázisra labilis védőcsoport, amelyet O- és S-védelemre használnak.

Az FMK, a fluor-metil-keton az RSK2 kináz irreverzibilis inhibitora.

9-A fluorenilmetoxikarbonil (Fmoc), az FMOC szilárdfázisú szintézisének amino-védőcsoportja, 20%-os piperidin/DMF-fel eltávolítható.

A formil a Boc-SPPS-ben használt indol védőcsoport. A Trp(For)-t HF hasítja merkaptán vagy bázisok, például piperidin jelenlétében.

A fluoreszcencia rezonancia energiatranszfer (FRET) a nem sugárzó energia átvitele egy gerjesztett fluoroforról (donor) egy megfelelő akceptorra (quencher). Az átvitel a távolságtól, a dipólus orientációjától, valamint a donor és az akceptor spektrális átfedésétől függ. A FRET szubsztrátokban a fluorofor és a kioltó peptidláncon keresztül kapcsolódik. Az enzimatikus hasítás növeli a fluoreszcenciát a donor és az akceptor elválasztásával.

A fluoreszcencia egy olyan anyag által kibocsátott fény, amely elnyeli a fényt vagy más elektromágneses sugárzást. Ez akkor fordul elő, amikor a fluorofornak nevezett molekulák meghatározott hullámhosszú fotonokat nyelnek el, gerjesztenek, majd fotonokat bocsátanak ki, és visszatérnek alapállapotukba. A kibocsátott fény általában hosszabb hullámhosszú és kisebb energiájú, mint az elnyelt fényé, ami jellegzetes fluoreszcencia spektrumot eredményez. Ezt a jelenséget széles körben használják számos tudományos és orvosi célra, beleértve a mikroszkópiát, az áramlási citometriát és a fluoreszcencia spektroszkópiát.

A gyomor-gátló polipeptid (GIP), más néven glükóz-függő inzulinotróp peptid, a hormonok szekretin családjába tartozik. Serkenti az inzulinszekréciót, gátolja a gyomorsav szekréciót, és döntő szerepet játszik az inzulinszekréció és a glükóz homeosztázis szabályozásában.

L- -A karboxiglutaminsav (Gla) a glutaminsav poszttranszlációs karboxilezése során képződik, és olyan fehérjéket eredményez, amelyek képesek megkötni a kalciumionokat, például az oszteokalcint. A Gla-tartalmú peptideket ideális esetben Fmoc szilárd fázisú peptidszintézissel (SPPS) szintetizálják, mivel a Gla erős savak jelenlétében dekarboxilezve glutaminsavat eredményez.

A glukagonszerű peptidek a proglukagon C-terminális régiójából származó peptidhormonok glukagon szupercsaládjának tagjai. Elsősorban a bél L-sejtjei szintetizálják őket.

A gonadotropin-felszabadító hormon (LHRH) egy dekapeptid hormon, amelyet a hipotalamusz neuroszekréciós sejtjei termelnek, és pulzáló kitörések során szabadulnak fel az agyalapi mirigy portális keringésében. A pulzáló szekréció kritikus a szaporodási funkciókhoz, a szexuális fejlődéshez és a differenciálódáshoz.

A növekedési hormont felszabadító hormon (GHRH), más néven szomatorelin, egy hipotalamusz peptid hormon, amely serkenti az agyalapi mirigyet a növekedési hormon felszabadulására és szintézisére.

A növekedési hormont felszabadító hormon (GHRH), más néven szomatorelin, egy hipotalamusz peptid hormon, amely serkenti az agyalapi mirigyet a növekedési hormon felszabadulására és szintézisére.

A humán leukocita antigén (HLA) a sejtek felszínén található fehérjék egy csoportjára utal, amelyek döntő szerepet játszanak abban, hogy az immunrendszer felismerje az idegen anyagokat. Emberben a fő hisztokompatibilitási komplex (MHC) génjei kódolják őket, és nélkülözhetetlenek az antigének T-sejtek számára történő bemutatásához, lehetővé téve az immunrendszer számára, hogy különbséget tudjon tenni saját és nem saját sejtek között. A HLA-molekulák nagyon változatosak és polimorfak, jelentősen hozzájárulva az egyéni immunválaszokhoz, valamint az autoimmun betegségekre és a transzplantátum kilökődésére való fogékonysághoz.

A 2-hidroxi-4-metoxibenzil egy savra labilis formamid védőcsoport, amelyet a peptidszintézisben a gerinc reverzibilis módosítására használnak. Aminosavként vagy Fmoc-Hmb dipeptidként (Fmoc-Xaa-HmbYaa-OH) épül be a szilárd fázisú Fmoc peptid szintézis (SPPS) során, megakadályozva az aggregációt és lehetővé téve a hatékony peptid kiterjesztést. A Hmb emellett segíti a ciklizációs reakciókat és megakadályozza az aszparagin képződését.

Az L-homoarginin az L-arginin homológja, rövidítve Har, és megtalálható a plazmában és a vizeletben. A homoarginin a lizin guanidinációjának eredménye, amely peptideken és fehérjéken is végrehajtható.

A homocitrullin az L-citrullin homológja, rövidítve Hci, és kimutatható az emberi vizeletben.

Az L-homocisztein a cisztein homológja, rövidítve Hcy, és a metionin demetilációjával keletkezik. A vér emelkedett Hcy-szintje a szív- és érrendszeri és a neurodegeneratív betegségek kockázati tényezője. A Cys származékokkal ellentétben a Hcy származékok nem racemizálódnak a kapcsolás során, ahogy az -elimin sem.

Az L-leucin homológjai, rövidítve Hle.

A homofenilalanin, a fenilalanin homológja, rövidítve Hph, az ACE- és renin-gátlók összetevője. Az Fmoc-Homophe-OH potenciális gyulladáscsökkentő gyógyszer.

L-homoprolin vagy L-pikolsav, rövidítve Pip vagy Hpr. A Hpr prolin homológ az L-lizin bomlásterméke. Mindkét enantiomer kimutatható humán plazmában. Mivel a prolin-maradékok erősen befolyásolják a peptid konformációját, a Pro helyettesítése Hpr-vel (vagy azetidin-2-karbonsavval (Aze)) módosíthatja a peptid másodlagos szerkezetét.

Az L-transzhidroxi-prolint a prolin oxidációjával poszttranszlációs úton állítják elő. A Hyp a kollagén és a kagylófehérje fő összetevője.

Az izoszerin, az L-szerin izomerje, egy aminosav.

Az ivDde, egy amino-védőcsoport, eltávolítható és lehasítható 2%-os hidrazin-hidráttal DMF-ben. Az ivDde stabilabb, mint a Dde, így gyakori a többszörös piperidinkezelés az Fmoc-SPPS során. Az Nω-ivDde szelektíven eltávolítható a Dap-ból, Dab Orn-ból vagy Lys-ből, lehetővé téve az Nω-aminocsoport szintetikus, gyantán történő módosítását.

A Keyhole limpet hemocyanin (KLH) egy nagy oxigénszállító több alegységű metalloprotein, amely az óriás kulcslyuk limpet hemocyanin hemolimfájában található. Antigénhordozóként a KLH általában növeli az immunogenitást és az antigén-rögzítő képességeket a célpolipeptid szekvenciák összekapcsolásával, jelentősen elősegítve a hatékony, specifikus és funkcionális antitestek képződését.

A luteinizáló hormont felszabadító hormon (LHRH vagy GnRH) egy dekapeptid hormon, amelyet a hipotalamuszban lévő neuroszekréciós sejtek szintetizálnak, és pulzálóan felszabadulnak az agyalapi mirigy portális keringésébe. A pulzáló szekréció kritikus a szaporodási funkcióhoz, a szexuális fejlődéshez és a differenciálódáshoz.

A peptidtervezés és -szintézis során a kutatók linkert illeszthetnek be a biotin vagy a fluoreszcens és a peptidek közé. Gyakori hidrofób távtartó az amino-hexánsav (Ahx), és egy általános hidrofil távtartó a poli(etilén)glikol (PEG).

Fagyasztva szárítási eljárás, amely eltávolítja a folyadékot a hőre érzékeny anyagokból. Az anyagot lefagyasztják, nagy vákuum alá helyezik, és alacsony hőmérsékleten tartják. A vákuum által létrehozott nyomás hatására a jég szilárd halmazállapotból gáz halmazállapotúvá változik anélkül, hogy áthaladna a folyékony halmazállapoton. A peptideket általában liofilizált por formájában szállítják.

A folyadékkromatográfia-tömegspektrometria egy sokoldalú analitikai technika, amely integrálja a folyadékkromatográfiát a tömegspektrometriával, hogy részletes információkat nyújtson a komplex mintákon belüli molekulák összetételéről és szerkezetéről.

Többféle antigén peptid. A többszörös antigén peptid az egyik hatékony módja a magas titerű antipeptid antitestek és szintetikus peptid vakcinák előállításának.

A mátrix-asszisztált lézeres deszorpciós/ionizációs tömegspektrometria (MALDI-MS) egy analitikai technika, amelyet az ionok tömeg/töltés arányának mérésére használnak. Különösen hasznos biomolekulák, például peptidek, fehérjék és polimerek elemzéséhez.

A tömegspektrometria (MS) egy hatékony analitikai technika, amelyet az ionok tömeg/töltés arányának (m/z) mérésére használnak.

A 4-metoxi- -naftilamid, rövidítve MNA, egy fluorofor, amely általában a C-terminálisnál kapcsolódik egy karboxipeptidáz szubsztráthoz. A hasított 4M NA 335-350 nm-en gerjeszt és 410-440 nm-en bocsát ki

A metoxibenzolszulfonil (Mbs) egy guanidil-védőcsoport, amelyet a Boc-alapú szilárd fázisú peptidszintézisben (Boc-SPPS) használnak. Ez a védőcsoport hidrogén-fluoriddal (HF) történő hasítással eltávolítható.

4-A metilbenzil (Mbzl) egy szulfhidril-védőcsoport, amelyet a Boc-alapú szilárd fázisú peptidszintézisben (Boc-SPPS) használnak. Az Mbzl stabilabb, mint a metoxibenzil (Mob) gyakori trifluor-ecetsavas (TFA) kezelések mellett, és hidrogén-fluoridos (HF) hasítással eltávolítható.

A (7-metoxi-kumarin-4-il)-ecetsav (Mca) egy fluorofor, amely aminocsoporthoz köthető.
Az Mca a dinitrofenilhez (Dnp) kötődik a fluoreszcens rezonancia energiatranszfer (FRET) szubsztrátjaihoz. A gerjesztési hullámhossz 325 nm, az emissziós hullámhossz pedig 392 nm.

A melanin-koncentráló hormon (MCH) egy ciklikus neuropeptid, amelyet először halakból és patkányokból izoláltak. Az MCH elsősorban a bőrpigmentáció szabályozásában vesz részt teleost halaknál és a táplálkozási viselkedés szabályozásában emlősöknél.

A metil, a legegyszerűbb alkil-szubsztituens, részt vesz az N-, ​​O- és S-metilezésben, amelyek a peptid állandó módosításait jelentik.

3-A metoxi-szukcinil, amely a dezaminált Asp(OMe)-nek felel meg, egy poláris N-terminális blokkoló csoport, amely általában beépül a karboxipeptidáz szubsztrátokba.

A metilezés a peptidek és fehérjék poszt-transzlációs módosítása (PTM), ahol egy metilcsoportot (-CH3) enzimatikusan adnak hozzá specifikus aminosav-maradékokhoz, általában lizinhez (Lys), argininhez (Arg), hisztidinhez (His) vagy glutamáthoz. Glu). Ez a módosítás jelentősen befolyásolhatja a fehérje működését, stabilitását és más molekulákkal való kölcsönhatásokat, ezáltal kulcsszerepet játszhat a különböző sejtfolyamatok szabályozásában, beleértve a génexpressziót, a jelátvitelt és a fehérje-fehérje kölcsönhatásokat.

A fő hisztokompatibilitási komplexum (MHC) egy genetikai régió, amely MHC-molekulákat kódoló géneket tartalmaz. Ezek a molekulák döntő szerepet játszanak az immunrendszerben és az autoimmunitásban. Emberben ezt a komplexet humán leukocita antigén (HLA) rendszerként is ismerik.

Az MHC I (MHC I) molekulák a sejtfelszínen lévő fehérjék, amelyek a sejt belsejéből peptideket mutatnak be a citotoxikus T-sejteknek. Ez segít az immunsejteknek felismerni és elpusztítani a fertőzött vagy abnormális sejteket, ami kulcsfontosságú a kórokozók és a rák elleni immunvédelem szempontjából.

Az MHC II (MHC II) molekulák olyan sejtfelszíni fehérjék, amelyek idegen anyagokból származó peptideket mutatnak be a segítő T-sejtek számára. Ez a kölcsönhatás elengedhetetlen az immunválaszok koordinálásához és más immunsejtek kórokozók elleni aktiválásához.

A monometilezett arginin (MMA) egy poszttranszlációs módosulás, amelyben egyetlen metilcsoportot (-CH3) adnak enzimatikusan a peptiden vagy fehérjén belüli argininmaradék guanidino-nitrogénjéhez.

3-merkaptopropil-amin, peptid ligandumként vagy módosítóként használható különféle biokémiai és orvosbiológiai alkalmazásokban.

A mirisztoilezés egy lipidmódosítási eljárás, amelyben egy 14-szén-telített zsírsavból álló mirisztoilcsoport kovalensen kapcsolódik a peptid N-terminálisához. Ez a módosítás arra szolgál, hogy a fehérjét a sejtmembránhoz rögzítse, megkönnyítve annak lokalizációját és részvételét a különböző sejtfolyamatokban.

A -(1-naftil)-L-alanin a fenilalaninhoz hasonló nem poláris aminosav-származék, de fenilcsoport helyett naftilcsoportot tartalmaz.

A -(2-naftil)alanin egy a fenilalaninhoz hasonló nempoláris aminosav-származék, de fenilcsoport helyett naftilcsoportot tartalmaz.

A 3-nitrobenz-2-oxa-1, 3-diazolt (NBD) általában az NBD-Cl reagens peptidhez való konjugálásával vezetik be. Az NBD-vel jelölt peptideket széles körben választják a membránokra és sejtbiológiára összpontosító vizsgálatokban való hasznosságuk miatt.

Az N-etilamid a C-terminális alanin dekarboxilált formájának tekinthető. Az LHRH agonista buserelinben az NHEt a C-terminális glicinamid analógjaként szolgál. Az N-etilamid peptid rezisztens a karboxipeptidázok általi lebomlással szemben.

Az L-norleucin (Nle) az L-metionin stabil izosztere. Ha egy peptid biológiai aktivitása a szulfoxid képződés miatt sérül, az Nle helyettesíthető Met-vel anélkül, hogy jellemzően megváltozna funkcionális viselkedése.

A NOTA, 1,4,7-triazaciklononán-1,4,7-triecetsav egy bifunkcionális kelátképző, amely keretként szolgál a PET képalkotó eszközök létrehozásához. A szondatervezésben és a multivalens hatások révén történő jelerősítésben is alkalmazzák, és potenciálisan alkalmazható diagnosztikai gallium radiofarmakonként.

Az N-Me általában az N-metilációt jelenti, egy olyan kémiai módosítást, amelyben egy metilcsoport (-CH 3 ) kapcsolódik a molekulában lévő nitrogénatomhoz, például N-Me-Gly, N-Me-Ser, N-Me -Tyr, N-Me-Thr, N-Me-Asp, N-Me-Glu, N-Me-Ala, N-Me-Phe, N-Me-Leu, N-Me-Ile, N-Me-Val, N-Me-Met, N-Me-Nle, N-Me-Nva stb.

A NODAGA,1,4,7-triazaciklononán,1-glutársav-4,7-diecetsav kiváló bifunkciós kelátképző fémorganikus radiofarmakonok tervezésében és fejlesztésében, jelentős mennyiségben kínálva a diagnosztikai képalkotásban és a célzott sugárterápiában való alkalmazás lehetősége.

2-A nitrofenil-tio (Nps) egy S-védőcsoport, amelyet a Boc-alapú szilárd fázisú peptidszintézisben (Boc-SPPS) használnak. Tiolok hasíthatják, különösen a cisztein szabad szulfhidril-csoportján (Cys) keresztül, ami egyidejű diszulfidkötés kialakulásához vezet.

A neuropeptid Y (NPY) egy kiemelkedő neuropeptid az agyban, és része a neuropeptid Y családnak, amely magában foglalja a hasnyálmirigy-polipeptidet (PP) és az YY peptidet (PYY).

A 2-nitro-2-piridilszulfenil (Npys) egy S-védőcsoport, amely kompatibilis a Boc-alapú szilárd fázisú peptidszintézissel (Boc-SPPS). Az Npys-t tiolok hasíthatják, különösen a cisztein szabad szulfhidril-csoportján (Cys) keresztül, ami egyidejű diszulfidkötés kialakulását eredményezi.

A norvalin egy nem poláris alifás aminosav és az -aminovajsav (Abu) homológja.

- A naftilamid egy fluorofor, amelyet általában karboxipeptidáz szubsztrátokban használnak, jellemzően a peptidek C-terminálisához kapcsolódnak. A hasított NA 330 nm-en gerjeszt és 370 nm-en bocsát ki.

- A naftilamid egy fluorofor, amelyet általában karboxipeptidáz szubsztrátokban használnak, jellemzően a peptidek C-terminálisához kapcsolódnak. Hasított NA 320-340 nm-nél, emisszió 410-420 nm-nél.

Az allil-észter egy karboxil-védőcsoport, amely mind az Fmoc-, mind a Boc-alapú szilárd fázisú peptidszintézissel (SPPS) kompatibilis. Az Aloc-hoz hasonlóan az allil-észterek Pd(PPh3)4-gyel történő kezeléssel szelektíven eltávolíthatók. Az Fmoc-SPPS-ben az Asp(OAll) érzékeny az aszpartimid báziskatalizált képződésére.

A benzil-észter, a karboxil-védőcsoport katalitikus hidrogénezéssel (pl. H2/Pd) vagy erős savakkal távolítható el.

Az OcHex a Boc-alapú szilárd fázisú peptidszintézisben (Boc-SPPS) használt standard karboxil-védőcsoport.

4-(N-[1(4,{4}}Dimetil-2,6-dioxociklohexilidén)-3-etilbutil]amino)benzil-észter (ODmab) karboxilvédő az Fmoc-alapú szilárd fázisú peptidszintézisben (Fmoc-SPPS) használt csoport. 2%-os hidrazin-hidráttal DMF-ben hasítható és eltávolítható.

A 2,4-dimetoxi-benzil-észter egy erősen savlabil karboxil-védőcsoport, amely 1%-os diklór-metános TFA-val eltávolítható.

Etil-észter, Az etil-észterek eltávolításához szükséges szigorú feltételek miatt a peptidek etil-észterekkel történő módosítása növelheti lipofilitásukat és stabilitásukat.

9-A fluorenil-metil-észter egy bázisra labilis karboxil-védőcsoport, amely eltávolítható piperidinnel DMF-ben.

Hexil-észterek Az etil-észterek eltávolításához szükséges szigorú feltételek miatt a peptidek etil-észterekkel történő módosítása növelheti lipofilitásukat és stabilitásukat.

Az L-otahidroindol-2-karbonsav (Oic) egy nempoláris gátolt aminosav. Ennek a prolinnal rokon aminosavnak a polipeptidszekvenciába való beépítése erősen befolyásolja a peptid konformációját.

A metil-észterek félpermanens C-terminális védőcsoportok a folyadékfázisú szintézisben, és peptid-hidrazidokká, reaktív peptid-azidok prekurzoraivá alakíthatók. A folyadékfázisú peptidszintézisben továbbra is az azid-kapcsolás a legnépszerűbb fragmentumkapcsolási módszer.

A 3-metil-pent-3-il-észter (OMpe) egy savra labilis karboxil-védőcsoport, amelyet gyakran alkalmaznak az aszparaginsav (Asp) karboxilcsoportjának védelmére az Fmoc-alapú szilárd fázisú peptidszintézisben (Fmoc-SPPS). Ezt a sztérikusabb terc-butil-észter analógot kifejezetten a báziskatalizált aszparagimid képződés csökkentésére fejlesztették ki.

A Boc- vagy Z-aminosavak orto-nitro-fenil-észterei a peptidoldat-szintézisben használt előaktivált származékok.

Az ornitin (Orn) a karbamidciklus során argininből termelődik, és peptidekben is megfigyelhető, mint arginin bomlásterméke. A peptidszintézis gyakori mellékreakciója az arginin guanidinrészének acilezésén keresztül történő ornképződés.

A hidroxi-szukcinimid-észter (OSu, rövidítve NHS) egy előaktivált aminosav-származék, amelyet általában peptidszintézisben, különösen peptidmódosításban használnak. Az OSu-észterek biztonságosak, nem sztérikusak, kompatibilisek a vizes rendszerekkel és könnyen kezelhetők.

Terc-butil-észter, savra labilis karboxil-védőcsoport az aminosavak számára a peptidszintézisben.

4-aminobenzoesav (para-aminobenzoesav), Használható antitest-gyógyszer konjugátum linkerek szintézisére. Például a Mal-PEG2-Val-Cit-PABA egy hasítható antitest gyógyszerkonjugátum (ADC) linker.

A PABC (para-aminobenzil-karbamát) egy kémiai vegyület, amelyet antitest-gyógyszer konjugátumok (ADC-k) szintézisében használnak linkerként. Megkönnyíti a gyógyszerek ellenőrzött módon történő kapcsolódását az antitestekhez, lehetővé téve a célzott gyógyszerbejuttatást a rákterápiákban és más orvosbiológiai alkalmazásokban. Például az Mc-Val-Cit-PABC-PNP egy katepszinnel hasítható linker, amelyet antitest-gyógyszer konjugátumokban (ADC) használnak.

A hipofízis-adenilát-cikláz-aktiváló polipeptid (PACAP) egy erősen konzervált neuropeptid, amely az emlős agyában kiemelkedően expresszálódik. Biológiai hatásait az intracelluláris ciklikus AMP szintjének fokozásával fejti ki receptorkölcsönhatáson keresztül.

Palmitoil, az N-terminálisra vagy oldalra bevezetett nem poláris acilcsoport. A palmitoilációt a fehérjék poszttranszlációs módosulásaként is megfigyelték.

A fenilacetamid metilgyanta egy kifejezetten Boc-alapú szilárd fázisú peptidszintézishez (Boc-SPPS) tervezett gyanta. Az ezen a gyantán szintetizált peptidek HF-hasítással szabadíthatók fel.

Az antitest-gyógyszer konjugátumokban (ADC) a linker összekapcsolja az antitestet a citotoxikus hasznos teherrel. A hasznos teher megválasztása kritikus, mivel ez határozza meg az ADC-k hatékonyságát és specifitását a célszövetekbe történő terápia specifikus felszabadítási mechanizmusokon keresztül történő eljuttatásában.

A 2,2,4,6,7-pentametil-dihidrobenzofurán-5-szulfonil (Pbf) az előnyben részesített guanidino-védőcsoport, amelyet az Fmoc-alapú szilárd fázisú peptidszintézisben (Fmoc-SPPS) használnak. A Pmc-hez képest valamivel magasabb savlabilitást mutat.

A penicillamin az L-cisztein analógja, amelyet egy metilcsoport (-CH3) karbonsavval (-COOH) való helyettesítése jellemez.

A peptid önszerveződése az, amikor a peptidek természetes módon rendezett struktúrákba rendeződnek külső beavatkozás nélkül. ezt a folyamatot nem kovalens kölcsönhatások, például hidrogénkötés, hidrofób kölcsönhatások, elektrosztatikus erők és π-π halmozás vezérlik. A peptid önszerveződése különféle nanostruktúrák, köztük rostok, gömbök, lapok és gélek kialakulásához vezethet, amelyek az anyagtudományban, a biotechnológiában és az orvostudományban is alkalmazhatók.

A fenilacetil (Phenylac vagy Phac) egy tipikusan a peptidek N-terminálisához kapcsolódó acilcsoport, amelyet az acetilhez (Ac) képest alacsonyabb polaritás jellemez. Ez a peptidek állandó módosítása.

A fenilglicin (Phg) egy olyan aminosav-származék, amelyben a fenilcsoport helyettesíti a hidrogénatomot a glicin molekulában

Peptide Histidin Isoleucin (PHI), a VIP-hez és a szekretinhez kapcsolódó sertés peptid.

Peptide hisztidin metionin (PHM), a VIP-hez kapcsolódó humán peptid.

Az izoelektromos pont (pI) az a pH-szint, amelyen a fehérje/peptid nettó töltése nulla (Smoluch et al., 2016).

A 2,2,5,7,8-pentametilkromán-6-szulfonil (Pmc) egy guanidinil-védőcsoport, amelyet általában az Fmoc-alapú szilárd fázisú peptidszintézisben (Fmoc-SPPS) használnak. A Pbf-hez képest valamivel kevésbé savlabilis.

A p-nitroanilin, egy kromofor, jellemzően a karboxipeptidáz szubsztrátok C-terminálisához van konjugálva. A felszabaduló p-nitro-anilin abszorpcióját általában 405 vagy 410 nm körüli hullámhosszon mérik.

Az L-Propargilglicint (Pra) mikroorganizmusok állítják elő. Ezt az aminosavat, amelyet hármaskötéses szerkezete jellemez, nagyra értékelik, mint a "kattintási kémiai" reakciókban részt vevő peptidek szintetizálásának alapegységét, amely jelentős figyelmet szentel a területen.

A parathormon (PTH) a mellékpajzsmirigyek által kibocsátott peptid hormon, amely kulcsfontosságú a kalcium és foszfor homeosztázisának fenntartásához az extracelluláris folyadékban.

A fehérjék poszttranszlációs módosításai (PTM) funkcionális csoportokat vagy fehérjéket adnak hozzá, szabályozó alegységeket vágnak le, vagy teljes fehérjéket bontanak le. Ezek a változások, mint a foszforiláció, glikoziláció, metilezés, acetiláció, lipidáció, ubiquitináció, nitroziláció és proteolízis, befolyásolják a sejtek normális működését és a betegség alatti működését. A PTM-ek megértése kulcsfontosságú az alapkutatás és az új kezelések megtalálása szempontjából.

piroglutaminsav, más néven rövidítések, mint a Pgl, Glp, pGlu vagy

A fenil-azobenzil-metoxikarbonil egy kromoforos N-védőcsoport, amelyet a peptidszintézisben használnak, katalitikus hidrogénezéssel vagy erős savval lehasítható. Maximális abszorpciós hullámhossza 229 nm, 320 nm és 441 nm.

A kioltó pár egy fluoreszcens molekulából (fluorofor) és egy kioltó molekulából áll, amelyeket fluoreszcencia alapú kutatásokban és vizsgálatokban használnak. A kioltó elnyeli a fluorofor által kibocsátott fényt, csökkentve a fluoreszcenciáját. Amikor a fluorofort és a kioltót elválasztják, például biokémiai reakcióval, a fluoreszcencia jel növekszik. Ez lehetővé teszi a kutatók számára, hogy valós idejű változásokat és interakciókat mérjenek. Ezt a technikát általában olyan alkalmazásokban használják, mint a valós idejű PCR, molekuláris próbák és FRET (Förster Resonance Energy Transfer) vizsgálatok.

A fluor{0}} egy radioligand, amelyet általában a PET-képalkotásban használnak a szövetekben a glükóz metabolizmusának értékelésére, és gyakran használják a rákdiagnosztikában és az agy képalkotásában.

A véletlenszerű peptidkönyvtár sok véletlenszerűen generált rövid peptidszekvencia gyűjteménye. A könyvtár minden peptidje meghatározott számú aminosavat tartalmaz, véletlenszerűen meghatározott szekvenciákkal, ami a peptidmolekulák változatos skáláját hozza létre. A kutatók ezeket a könyvtárakat használják specifikus tulajdonságokkal, biológiai aktivitással vagy célmolekulákkal való kölcsönhatásokkal rendelkező peptidek szűrésére. Különösen hasznosak a gyógyszerkutatásban, az immunológiában és a fehérje-fehérje kölcsönhatások vizsgálatában, segítve az új terápiák azonosítását és a komplex biológiai folyamatok megértését.

A maradék egy egyedi aminosav egy peptiden vagy fehérjén belül. Amint az aminosavak peptidkötéseken keresztül kapcsolódnak egymáshoz, és létrehozzák ezeket a láncokat, minden aminosav egységet maradéknak nevezünk. Ezt a kifejezést azért használják, mert a peptidkötés kialakulása során minden aminosav elveszít egy vízmolekulát (H2O), ami egy maradékként emlegetett anyagot hagy maga után.

A gyanta egy oldhatatlan polimer, amelyet a szilárd fázisú peptidszintézisben (SPPS) használnak szilárd hordozóként az aminosavak folyamatos hozzáadásához. A gyantagyöngyök stabil és inert felületet biztosítanak, amelyhez a kezdeti aminosavak kovalensen kapcsolódnak, lehetővé téve a peptidlánc aminosavról-maradékra való felépítését.

A rodamin B egy élénk rózsaszíntől a vörösig terjedő színezék, amelynek gerjesztési hullámhossza általában 540-570 nm, kibocsátott fénytartománya pedig 560-580 nm. Általában a peptid N-terminális aminocsoportján keresztül kapcsolódik a peptidszekvenciához

Fordított fázisú, nagy teljesítményű folyadékkromatográf.

A szerkezet-aktivitás kapcsolat (SAR) gyógyszereket a gyógyszer kémiai szerkezete és biológiai aktivitása közötti kapcsolat tanulmányozásával fejlesztették ki.

A szarkozin, a legegyszerűbb N-alkilezett aminosav.

A szimmetrikus dimetilarginin(SDMA, Arg(Me)2), Fmoc-Arg(Me)2-OH (szimmetrikus) közvetlenül felhasználható szimmetrikus dimetilarginint tartalmazó peptidek szintézisére.

A szilárd fázisú peptidszintézis (SPPS) egy módszer peptidek kémiai szintézisére, ahol a peptideket lépésenként állítják össze szilárd hordozón vagy gyantán védett aminosavak egymás utáni hozzáadásával. Az SPPS két stratégiát foglal magában: Fmoc-SPPS és Boc-SPPS, amelyek különböznek az N-aminocsoport védőcsoportok (Fmoc vagy Boc) és az oldallánc védőcsoportok megválasztásában. A kiválasztott N-amino-védőcsoport típusa határozza meg az oldallánc-védelmi stratégiát és a peptid gyantáról való végső lehasításának feltételeit.

A statin, rövidítve Sta, egy nem fehérje aminosav, amelyet gyakran használnak peptid mimetikumok tervezésében, különösen a proteáz inhibitorok szintézisében.

A terc-butiltio (StBu) egy S-védőcsoport, amely foszfinredukcióval hasad, és kompatibilis a Boc-SPPS-sel.

A szukcinil egy poláris N-terminális módosítás, amely megfelel a dezaminált aszpartátnak, és jellemzően karboxipeptidáz szubsztrátokba épül be.

A TAMRA, más néven TMR, egy fluorofor, amely aminocsoporthoz kapcsolódhat. Gyakran használják a FAM-mal együtt FRET aljzatokhoz. A TAMRA gerjesztési hullámhossza 485 nm és emissziós hullámhossza 535 nm.

A terc-butil egy savra labilis védőcsoport, amelyet általában alkoholokhoz és fenolokhoz használnak, és amely trifluor-ecetsavval (TFA) hasítható.

A trietil-ammónium-foszfát egy fordított fázisú HPLC mozgófázisokban használt puffer.

Trifluor-ecetsavat (TFA) használtunk a peptid lehasítására a gyantáról Fmoc-SPPS-ben és a tBu-ból származó védőcsoportok eltávolítására.

A trifluor-metánszulfonsav (TFMSA) erősebb sav, mint a TFA. A TFMSA a rendkívül toxikus HF biztonságosabb alternatívájaként használható a Boc-SPPS stratégia végső hasítási lépésében.

Az L-terc-leucin (Tle) egy nem poláris aminosav, sztérikusan igényes oldalláncokkal, amely destabilizálja a hélixeket.

A 2,4,6-trimetoxibenzil egy savra labilis Asn és Gln amid védőcsoport, amelyet az Fmoc-SPPS-ben használnak.

A tozil a guanidin és az imidazol védőcsoportja a Boc-SPPS-ben, és Na/NH3-mal eltávolítható.

A tritil (Trt) egy savra labilis védőcsoport, amelyet az Fmoc-SPPS-ben az Asn, Cys, Gln és His csoportokhoz alkalmaznak. Trifluor-ecetsavval (TFA) szelektíven eltávolítható.

A tiszta peptidek jellemzően fehér porállapotban léteznek fagyasztva szárítás után.

A vasoactive intestinal peptid (VIP) egy 28-aminosav peptid, amely a glukagon-ghrelin-szekretin peptid szupercsaládba tartozik.

9-A xanthidril (Xan) egy savra labilis amid védőcsoport, amelyet a Boc-SPPS-ben lévő Asn és Gln maradékokhoz használnak. A Xan szelektíven eltávolítható TFA segítségével.

Ha a peptidet FAM fluoreszceinnel jelölik, a liofilizált por jellemzően sárga megjelenést mutat.

A Z-benzil-oxi-karbonil-csoportot, rövidítve Z vagy Cbz, amino-védőcsoportként használják a peptidszintézisben. Eltávolítható hidrogenolízissel vagy erős savakkal, mint tiszta HF vagy HBr/ecetsav.